Câu lạc bộ được Ngungunyane Matsenjwa thành lập, với mục đích đưa những đứa trẻ ở vùng Moneni ngoại ô Manzini lại với nhau.

Trước khi câu lạc bộ được Matsenjwa tiếp quản, tên cũ là The Blue Birds Football Club. Năm 1967, câu lạc bộ đổi tên thành Moneni Pirates FC, lấy theo cảm hứng của những gã khổng lồ Soweto, Orlando Pirates. Nhiều câu lạc bộ ở Eswatini đều đặt tên theo các câu lạc bộ nổi tiếng ở Nam Phi. Đó là bởi vì những người hâm mộ bóng đá Eswatini theo dõi các câu lạc bộ ở Nam Phi, và các câu lạc bộ địa phương muốn đưa những tài năng đến giải đấu Premier Soccer League chuyên nghiệp hơn.

Câu lạc bộ bị xuống hạng 3 lần trong lịch sử  – ở các mùa giải 1998–1999, 2005–06 và 2014–15. Sau đó đội nhanh chóng thăng hạng trong cả ba lần xuống hạng, với lần cuối cùng xảy ra khi đội về đích thứ 2 ở Giải hạng nhất mùa giải 2015-16.